“從這個洞里的樣品中，我們第一次檢測到了和SARS病毒更相近的SARS樣冠狀病毒S基因。比起其他的采樣地點，云南的這個洞，更值得我們關注。”從這一年開始，云南的這個蝙蝠洞被定為長期采樣地點。
一直到2015年10月，每年的春秋兩季，研究團隊都會到那里去。
研究組在野外作業(yè)。中國科學院武漢病毒研究所供圖
“春天是蝙蝠的繁殖季節(jié)，秋天則是冠狀病毒檢測出陽性率最高的季節(jié)。”胡犇解釋。
這個洞穴的溫度大約在22℃到25°C之間,，濕度在85% 到90%左右。這里棲息著一個數(shù)量龐大的菊頭蝠種群。在整個云南，類似的蝙蝠洞其實并不罕見。
黃昏時，研究團隊會在洞里的地面鋪上一塊布，第二天早上收走采集了一夜的新鮮蝙蝠糞便。每粒糞便樣本大約1克重，被放在1毫升的收集溶液里，帶回實驗室，儲存在零下80°C的冷凍箱里。在實驗室里，樣品中的病毒RNA被提取出來。
2013年，中科院武漢病毒研究所實驗室，從糞便樣品中，分離出第一株蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒的活病毒，它被命名為WIV1(WIV是武漢病毒研究所的英文簡稱)。它比之前發(fā)現(xiàn)的任何一株蝙蝠SARS樣冠狀病毒都更接近SARS冠狀病毒，正是那段相近的S基因，讓這株蝙蝠SARS 樣冠狀病毒能夠使用和SARS病毒相同的受體，并能夠感染人的細胞。這項成果刊載于2013年11月的《自然》雜志。
第二個里程碑立起來了。
SARS病毒起源問題，終于可以被回答了
成功分離出WIV1，讓全球科學家對SARS病毒起源的分歧、爭論，變得“趨于一致”。這場已經(jīng)持續(xù)多年的追捕，目標漸漸清晰——SARS冠狀病毒起源于菊頭蝠。
“但是，我們在云南這個采樣點的蝙蝠當中，還沒有找到SARS病毒最直接的祖先株。也就是說，在所有的基因上，都和SARS病毒高度相似的一株蝙蝠病毒，我們并沒有找到。”按照胡犇的說法，當時的整個證據(jù)鏈上，還有一個信息缺口沒填上。
對云南這處蝙蝠洞的采樣工作，持續(xù)了5年，共10次采集，收集到64份蝙蝠糞便粒和肛拭子樣品。研究組從這些樣品中，陸續(xù)分離出3株活病毒，得到了共計15株蝙蝠SARS樣冠狀病毒的全長基因組序列。
與造成非典疫情的SARS病毒相比，這15株病毒有的S基因高度同源，個別附屬基因不同，有的附屬基因高度相似，卻在S基因上差異明顯。
盡管沒有一株病毒與SARS病毒完全相同，研究組卻發(fā)現(xiàn)，在這15株病毒當中，包含了SARS病毒所有的基因組組分。
“我們考慮到一個可能性——這個蝙蝠種群攜帶的不同的病毒之間出現(xiàn)了基因重組，產(chǎn)生了SARS病毒。”胡犇說。
2016年2月的一天，針對15株蝙蝠SARS樣冠狀病毒基因信息的基因重組推導在計算機中開始進行。最終結果證實了研究組的推測。
研究組正在進行樣本處理。中國科學院武漢病毒研究所供圖
“云南的這個蝙蝠洞，就像一個SARS樣冠狀病毒基因庫。不管是S基因、附屬基因還是非結構蛋白基因，SARS病毒的全部基因組組分，都可以在這個天然基因庫中找到。”胡犇告訴中國青年報·中青在線記者，“我們在這些蝙蝠SARS樣病毒的基因組上多個位點發(fā)現(xiàn)了頻繁重組的證據(jù)，通過進一步分析，我們推測，造成當年疫情的SARS冠狀病毒的直接祖先可能通過這些蝙蝠SARS樣冠狀病毒的祖先株之間發(fā)生的一連串的重組事件而產(chǎn)生。”
SARS病毒起源尚存的問題，終于可以被回答了。
研究組提出了猜想：SARS冠狀病毒的直接祖先株，在云南或者西南地區(qū)的某個蝙蝠種群中出現(xiàn)了。在偶然的情況下，病毒感染了野生果子貍，帶病的果子貍被人類被捕捉。也有可能，是攜帶病毒的蝙蝠接觸了當?shù)氐墓迂傪B(yǎng)殖場。當果子貍抵達廣東的野生動物市場后，病毒在其體內發(fā)生了快速進化，以SARS病毒的最終樣態(tài)接觸到了人類。
然而，一切都只是推測，15年前的那個過程，不可能被還原了。
“這項發(fā)現(xiàn)告誡我們，須減少對蝙蝠等野生動物棲息地的侵擾、杜絕野生動物市場交易，這對于防止新發(fā)傳染病的發(fā)生至關重要。” 香港大學微生物學家袁國勇教授對這項研究發(fā)表評論稱。
“蝙蝠攜帶的SARS樣冠狀病毒需要引起我們的重視，但是也無需過度緊張。只要我們和自然棲息地的蝙蝠保持一定的距離，病毒從蝙蝠溢出的可能性很小。”胡犇說，“另外需要指出的是中間宿主，也就是和人類接觸機會更多的這些動物，在病毒從自然宿主到人的這個傳播鏈中往往扮演著關鍵角色。所以說，不光是和蝙蝠保持距離，還需要停止消費果子貍等野生動物，將疾病暴發(fā)風險降至最低。”
胡犇把病毒監(jiān)測與病毒發(fā)現(xiàn)工作稱為“病毒研究的上游”，能為“下游”的防治工作、診斷方法與疫苗研發(fā)以及其它基礎研究奠定基礎。這項研究意味著，類似SARS的新發(fā)冠狀病毒病，仍然存在著爆發(fā)的風險，為相關疾病的預防提供了依據(jù)。
“這回發(fā)現(xiàn)的完整的SARS樣冠狀病毒基因庫，可以讓疾控專家用軟件提前模擬出還沒有出現(xiàn)過、很可能出現(xiàn)的、能夠感染人類的病毒，我們可以提前研究疫苗，研究對策。”中國科學院院士、中國疾病預防控制中心主任高福對中國青年報·中青在線記者說。
他將SARS疫情之后的中國疾控工作，稱為“砥礪前行”，“發(fā)生MERS(中東呼吸綜合征冠狀病毒)疫情的時候，我們就不像2003年時那樣了，很快把MERS控制住了。”
2003年5月9日，《中華人民共和國國務院令(第376號)——突發(fā)公共衛(wèi)生事件應急條例》發(fā)布，要求建立突發(fā)事件應急報告制度，在“發(fā)生或可能發(fā)生傳染病爆發(fā)、流行”，以及“發(fā)現(xiàn)不明原因的群體性疾病”等情況后，各級政府要在接到報告1小時之內，向國務院衛(wèi)生行政主管部門報告。
2005年，國家投入116億元，建立以疾病預防控制機構為中心的疾病防控體系，作為解決突發(fā)公共衛(wèi)生事件的應急系統(tǒng)。
“非典”之后，北京市各級疾控部門都開始針對突發(fā)公共衛(wèi)生事件進行培訓和演練。北京市衛(wèi)計委疾控部門建立了一套24小時不間斷運轉的傳染病監(jiān)測網(wǎng)絡。2012年，北京市投入1.75億元，為市區(qū)兩級疾控機構配備儀器裝備。
在高?？磥?，一流的疾控，需要一流的科研成果來支撐，體現(xiàn)在與疾控有關的基礎研究和應用研究上。
提到石正麗，他開了個玩笑：“我們都叫她Bat Woman，蝙蝠女俠。”
原標題：專家在洞穴找到SARS真兇蝙蝠 但果子貍也沒被冤枉
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